«کافه مدرسه» بناست جایی برای دورهمی‌های فکری و گفت‌وگومحور دانش‌آموزان باشد. مدرسه است از آنجا که بناست مکان آموزاندن و آموختن باشد و کافه، از آنجا که بناست به‌دور از ساختارهای محدودساز و سرکوبگرانۀ مدرسه در معنای رایجش، امکان گفت‌وگویی جمعی و برابر را شکل دهد. دغدغۀ اصلی کافه مدرسه پرورش فکری دانش‌آموزان و همراهی آنان در راه خلق دانش است. برنامه‌های ما در قالب «فنجان» برگزار می‌شود؛ هر فنجان به موضوعی خاص اختصاص دارد و از دو بخش کلی تشکیل می‌شود. بخش نخست، درسگفتاری در یک یا چند جرعه (جلسه) دربارۀ ابعاد مختلف موضوع آن فنجان است و بخش دوم، متن‌خوانی در یک یا چند جرعه (جلسه) مبتنی بر همان موضوع. در بخش نخست بناست مقدمات ضروری برای گفت‌وگوی خلاقانه دربارۀ موضوع را فراگیریم و در بخش دوم، به میانجی متون انتخابی تلاش می‌کنیم مواجهه‌ای نقادانه با موضوع داشته باشیم و فراتر از کلیشه‌های روزمره به آن بیاندیشیم. کافه مدرسه از حضور همه در نشست‌هایش استقبال می‌کند اما امکان مشارکت در گفت‌وگوها تنها برای دانش‌آموزان وجود دارد تا نابرابری سرمایه‌های اجتماعی و فرهنگی «بزرگسالان» و «نوجوانان» منجر به سرکوب زبانی آنان نشود. کافه مدرسه مدافع «دانش برای همگان، آزاد و رایگان» است و از این رو حداکثر تلاش خود را می‌کند تا محتوای آموزشی خود را به‌رایگان و به‌طور عمومی منتشر سازد.